转录组学

实验介绍

外泌体RNA是一种具有重要生物学功能的RNA，包括mRNA、miRNA、lncRNA等多种类型。外泌体RNA测序是通过对外泌体RNA的测序，来获得RNA序列信息，从而对RNA进行分析和研究。外泌体RNA测序技术已经被广泛应用于癌症、神经退行性疾病、心血管疾病等多种疾病的研究中。外泌体RNA可以作为一种重要的生物标志物，为疾病的诊断、治疗和预后等方面提供了重要的科学依据。外泌体RNA测序技术服务项目通常包括外泌体RNA的提取、测序、数据分析等多个环节。通过这些环节，研究人员可以获得外泌体RNA的全面信息，包括RNA表达水平、剪接变异、转录后修饰等信息，进而对RNA的功能进行分析和研究。

1. Small RNA测序

Small RNA主要包含miRNA、piRNA、tsRNA和snoRNA等RNA分子。小RNA参与基因表达与调控、RNA的加工与剪切、蛋白质翻译、遗传“入侵”抑制、配子发生等重要生物学过程，是生命活动中不可少的调控因子。微小RNA（microRNA，简称miRNA）是小RNA的最主要部分，已被证明与包括癌症、心血管疾病、免疫系统疾病在内的多种疾病密切相关。此外，外泌体miRNA也可以作为疾病的生物标志物，广泛应用于疾病诊断、个性化治疗和预后等领域。高通量测序技术可以在单次测序中获得样品中所有小RNA的序列信息，从而分析不同疾病状态、不同样品来源、不同处理条件下小RNA的表达水平，并精确比较其之间的小RNA表达差异，从而为后续研究小RNA的生物学意义提供指引。

当前实验室采用基于QIAseq的建库体系，最低1ng总RNA即可完成miRNA建库，并且优化的反应化学可实现构建稳定的miRNA特异性文库，最大限度地减少反应偏差并消除接头二聚体。独特的分子标签（UMI）在早期阶段标记每个miRNA，消除了PCR和测序偏差，是目前外泌体样品miRNA建库相对数据质量较高的建库方案。

2. 非编码RNA测序

外泌体RNA特别是非编码RNA，在不同的疾病模型中存在明显的表达差异，有望成为液体活检的重要分子标志物，并揭示疾病发生的机理。利用高通量转录组测序技术可以同时检测其所含RNA分子如lncRNA、mRNA、circRNA，对外泌体非编码RNA分子鉴定和调控功能进行研究。

当前实验室采用基于SMARTer的建库体系，最低1ng总RNA即可完成LncRNA建库，后续测序数据可单独进行LncRNA和mRNA分析，也可以联合miRNA测序数据进行全转录组分析（包含LncRNA、mRNA、CircRNA、miRNA）。

检测项目

服务序号	服务内容	服务说明	服务周期
1	RNA提取	采用外泌体专用微量RNA提取试剂盒提取RNA并检测浓度，交付：XLSX格式RNA浓度数据	3个工作日
2	RNA质控	采用毛细管电泳的方法检测核酸的片段分布，仪器平台：Qsep100，交付：PDF格式样品分析报告，BOPX格式仪器原始数据	1个工作日
3	miRNA测序	包含建库质控、上机测序、标准分析，采用微量建库方案，Illumina平台PE150测序策略，数据产出10M reads（3G Rawdata），交付：miRNA HTML格式分析报告，WORD格式文库质控报告，FASTQ测序原始数据	20个工作日
4	LncRNA测序	包含建库质控、上机测序、标准分析，采用微量建库方案，Illumina平台PE150测序策略，数据产出10G Rawdata，交付：LncRNA\mRNA HTML格式分析报告，WORD格式文库质控报告，FASTQ测序原始数据	20个工作日
5	全转录组测序	包含建库质控、上机测序、标准分析，采用微量建库方案，Illumina平台PE150测序策略，数据产出13G Rawdata，交付：LncRNA\mRNA\CircRNA\miRNA HTML格式分析报告，WORD格式文库质控报告，FASTQ测序原始数据	20个工作日

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