外泌体RNA是一种具有重要生物学功能的RNA,包括mRNA、miRNA、lncRNA等多种类型。外泌体RNA测序是通过对外泌体RNA的测序,来获得RNA序列信息,从而对RNA进行分析和研究。外泌体RNA测序技术已经被广泛应用于癌症、神经退行性疾病、心血管疾病等多种疾病的研究中。外泌体RNA可以作为一种重要的生物标志物,为疾病的诊断、治疗和预后等方面提供了重要的科学依据。外泌体RNA测序技术服务项目通常包括外泌体RNA的提取、测序、数据分析等多个环节。通过这些环节,研究人员可以获得外泌体RNA的全面信息,包括RNA表达水平、剪接变异、转录后修饰等信息,进而对RNA的功能进行分析和研究。
1. Small RNA测序
Small RNA主要包含miRNA、piRNA、tsRNA和snoRNA等RNA分子。小RNA参与基因表达与调控、RNA的加工与剪切、蛋白质翻译、遗传“入侵”抑制、配子发生等重要生物学过程,是生命活动中不可少的调控因子。微小RNA(microRNA,简称miRNA)是小RNA的最主要部分,已被证明与包括癌症、心血管疾病、免疫系统疾病在内的多种疾病密切相关。此外,外泌体miRNA也可以作为疾病的生物标志物,广泛应用于疾病诊断、个性化治疗和预后等领域。高通量测序技术可以在单次测序中获得样品中所有小RNA的序列信息,从而分析不同疾病状态、不同样品来源、不同处理条件下小RNA的表达水平,并精确比较其之间的小RNA表达差异,从而为后续研究小RNA的生物学意义提供指引。
当前实验室采用基于QIAseq的建库体系,最低1ng总RNA即可完成miRNA建库,并且优化的反应化学可实现构建稳定的miRNA特异性文库,最大限度地减少反应偏差并消除接头二聚体。独特的分子标签(UMI)在早期阶段标记每个miRNA,消除了PCR和测序偏差,是目前外泌体样品miRNA建库相对数据质量较高的建库方案。
2. 非编码RNA测序
外泌体RNA特别是非编码RNA,在不同的疾病模型中存在明显的表达差异,有望成为液体活检的重要分子标志物,并揭示疾病发生的机理。利用高通量转录组测序技术可以同时检测其所含RNA分子如lncRNA、mRNA、circRNA,对外泌体非编码RNA分子鉴定和调控功能进行研究。
当前实验室采用基于SMARTer的建库体系,最低1ng总RNA即可完成LncRNA建库,后续测序数据可单独进行LncRNA和mRNA分析,也可以联合miRNA测序数据进行全转录组分析(包含LncRNA、mRNA、CircRNA、miRNA)。
检测项目
服务序号 | 服务内容 | 服务说明 | 服务周期 |
1 | RNA提取 | 采用外泌体专用微量RNA提取试剂盒提取RNA并检测浓度,交付:XLSX格式RNA浓度数据 | 3个工作日 |
2 | RNA质控 | 采用毛细管电泳的方法检测核酸的片段分布,仪器平台:Qsep100,交付:PDF格式样品分析报告,BOPX格式仪器原始数据 | 1个工作日 |
3 | miRNA测序 | 包含建库质控、上机测序、标准分析,采用微量建库方案,Illumina平台PE150测序策略,数据产出10M reads(3G Rawdata),交付:miRNA HTML格式分析报告,WORD格式文库质控报告,FASTQ测序原始数据 | 20个工作日 |
4 | LncRNA测序 | 包含建库质控、上机测序、标准分析,采用微量建库方案,Illumina平台PE150测序策略,数据产出10G Rawdata,交付:LncRNA\mRNA HTML格式分析报告,WORD格式文库质控报告,FASTQ测序原始数据 | 20个工作日 |
5 | 全转录组测序 | 包含建库质控、上机测序、标准分析,采用微量建库方案,Illumina平台PE150测序策略,数据产出13G Rawdata,交付:LncRNA\mRNA\CircRNA\miRNA HTML格式分析报告,WORD格式文库质控报告,FASTQ测序原始数据 | 20个工作日 |
微环DNA表达双靶向抗体的癌症免疫治疗技术成为继CAR-T技术(“嵌合抗原受体T细胞免疫疗法”)、TIL技术(“肿瘤渗润淋巴细胞技术)、免疫检查点抑制剂等技术之后又一项获得成功的新一代治疗技术。